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中国科学院微生物研究所副研究院张新宇

 

中国科学院微生物研究所副研究院张新宇

  嘉宾介绍:

  张新宇,博士,副研究员。1995年获山东大学生物化学学士学位。2007年在清华大学获博士学位,研究方向为生物信息学。2009年至2011年在清华大学计算机系做博士后研究,方向是异质高通量数据整合算法研究。2011年3月至今在中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室负责生物信息学平台,任创新性平台中心主任。目前已在国际刊物上发表研究论文20余篇。

  演讲主题:高通量测序生物信息学平台及分析案例简介

  主题概述:着人类基因组测序计划的完成,以及下一代测序技术的迅速推广普及,全球两千多台测序仪每时每刻都在产生数以T计的测序数据,数据的产生速度远超数据储存和计算能力增长速度。如何管理以及全面分析这些生物学数据,从中去粗取精,去伪存真,并提取其中的生物学知识,已经成为生物学家和生物学实验室的难题。在此,我们介绍一个以曙光高性能计算集群系统作为硬件支持,以国际先进流行的专业分析流程作为软件系统,通过生物信息学专业团队构建的一个高通量数据分析平台。该平台架构于功能基因组学,比较基因组学,系统生物学等三个不同层次,可以对基因组和转录组测序数据以及蛋白质组数据进行深入分析,包括从测序生数据质控开始,一直到系统生物学分析(对各种组学数据的整合)。该平台自2011年建设以来,已经成功分析了14个新测序的真菌基因组和转录组,2个放线菌基因组及转录组,合作发表SCI论文5篇。

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