实际使用的技术

　　服务：戴尔咨询服务部门；

　　硬件：戴尔PowerEdge M600和M610刀片服务器，搭载英特尔至强L5420处理器

　　戴尔PowerEdge M1000e模块化刀片机箱

　　软件：红帽企业Linux、Rocks Cluster管理软件

　　两个月内而不是两年内看到结果

　　项目的第二个阶段将添加68个节点的戴尔PowerEdge M610刀片服务器(搭载英特尔至强L5520处理器)。Kusalik还计划实施InfiniBand互连技术，以加快这些节点之间的通信速度。英特尔至强5500系列处理器将提升性能，并且让研究生们可以运行以前因时间紧张而无法运行的计算。

　　Kusalik说：“算法效率开始下降、处理速度变慢之前，并行处理的扩展能力只能到一定的程度。可是我们需要研究非常大的系统，以便观察我们感兴趣的现象。某一次计算所花的时间太重要、太有意义了。学生们要等几个月才能看到计算结果，但不用像以前那样要等好几年。搭载英特尔至强5520处理器的戴尔刀片让我们有望运行原本无法企及的大规模计算。”

　　迄今为止没有硬件问题

　　戴尔咨询服务团队协助一名现场工程师实施了该集群，戴尔商业合作伙伴APC Systems公司负责了所有的机架和冷却工作。Kusalik说：“戴尔和HPC的人员出色地安装了集群。他们的表现给我留下了很深刻的印象。我们以前也构建过另外几个集群;我遇到的情况总是这样，在首次上电期间、第一个月投入使用时，我们总是有几个部件无法使用，只好把它们换掉。而这回，我们在开机测试期间根本没遇到部件无法使用的情况。”

　　实际上，自集群投入使用以来，工作团队还没有遇到要求更换部件的硬件问题，集群的利用率实现了每周7天、每天24小时都高达80%。

　　挽救生命的应用

　　明白了无序状态到有序状态的转变，有望带来影响巨大的许多科学发现。肾结石是一种折磨人的疾病，影响着美国10%到15%的成年人，最近一年的治疗费用就高达20亿美元。了解晶体如何形成有望带来预防性措施，通过防止尿酸晶体形成，从而降低肾结石的发病率。

　　另一方面，蛋白质折叠是一个自然发生的过程;在这个过程中，无序的蛋白质链变成了清晰可辨的三维结构。对于许多蛋白质来说，正确的三维结构是蛋白质起到正常功能所必不可少的。研究发现，不正确的蛋白质折叠与克罗伊费尔特-雅各病以及老年痴呆症、杭廷顿氏舞蹈病和帕金森氏病等疾病与有关。了解蛋白质折叠现象有望带来治愈这些疾病的方法

　　不怕冻伤

　　这项研究成果的另一个潜在用途有望带来农业和水产业方面取得重大突破。Kusalik说：

　　“我的一名研究生对一组名为抗冻蛋白质的蛋白质产生了浓厚兴趣。比如说，你可能在寒冷环境下养鱼，这时鱼内体液会处在冰融点以下的温度。按理说，鱼会冻伤冻死，但实际上没有。这些抗冻蛋白质防止了结成冰。我们一直发现的现象之一是，这些抗冻蛋白质与某种复杂过程似乎有着相当紧密的联系。如果我们能明白这些蛋白质的工作原理，就能定制出具有这种特性的蛋白质或聚合物，然后运用到农作物上，让它们具有抗冻的特性。”

　　这项研究甚至可以运用到巧克力的生产上。Kusalik说：“你不希望生产的巧克力出现晶体。所以，可以想象的其中一件事就是往巧克力当中添加某种材料，以防止出现结晶。这样一来，巧克力不仅仅一周保持美味可口，还有可能好几个月都保持美味可口。”

　　而这是每个人都能享受到的好处。