【IT168 报道】美国SGI公司今天宣布为国内两家主要SARS病毒研究机构：中科院基因组生物信息学中心（北京华大基因研究中心）和上海药物研究所提供最新的SGI Origin系列超级计算机以及相关可视化系统，以期利用SGI在超级计算和分子结构模拟与显示领域的独特技术，加速国内对SARS病毒染色体的研究和相应疫苗及特效药的开发。截止到今天，上海药物研究所已经成功构造了一定数量的SARS病毒蛋白质的3D模型，并利用潜在药物化合物数据库对病毒蛋白质进行了虚拟显示。
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SGI向上海药物研究所提供了一台配置64个处理器的SGI Origin 3800超级计算机、一台配置4个处理器的SGI Origin 3200系统和15台SGI图形工作站。这些设备可以模拟和显示数以百万计的分子结构，并从中开发可抗击SARS病毒的化合物。SGI Origin服务器主要依靠著名的NUMAflex超级计算架构、共享内存和OpenGL应用软件系统来处理数据密集型的虚拟显示应用，同时存储诸多大型化学数据库。针对SARS病毒可变异的特性，Origin超级计算机将用于绘制病毒突变部位，创建数据集来描述变异蛋白质的精确结构。研究人员将利用SGI图形工作站建立这些变异蛋白质结构的3D模型，实时分析虚拟显示的结果。具体来说，上海药物研究所利用SGI的超级计算机从事以下研究：分析SARS病毒的染色体排序，识别有可能造成这种传染病的重要蛋白质；预估病毒蛋白质的可能变种；构造病毒蛋白质的3D模型，进行虚拟演示，以期发现抗击SARS病毒的药品化合物；合成药物并虚拟显示3D结构；进行抗病毒测试。
上海药物研究所SARS研究组组长蒋华良博士解释说："我们提供化学和药理学领域的海量虚拟显示，希望在接下来的三个月里可以找到一种能够抗击SARS病毒的高效化合物。SGI Origin超级计算机有着令人难以置信的性能和稳定性。我们的SGI工作站为3D模型的构造提供了至关重要的可视化保证。"
中科院基因组生物信息学中心是国际染色体工程协会成员，是亚洲太平洋地区最大的非赢利性的染色体研究机构，也是世界三大染色体研究中心之一，该研究所采用了两台SGI 32处理器的Origin3000超级计算机，一台5TB TP9100存储系统以及若干SGI可视化系统。这些技术主要应用于SARS病毒主要染色体和相关蛋白质排序模型创建和虚拟显示，以及多种计算应用。
中科院基因组生物信息学中心北京所和生物信息学部负责人王军先生说："中心担负三重使命-给所有种类的染色体，特别是农作物染色体组排序， 加强对DNA、RNA、蛋白质结构和生物信息的研究，以及从事与人类健康密切相关的研究，包括SARS 病毒、基因型和抗体-抗原的研究。所有这些使命对高性能计算都有苛刻需求，尤其是在比较研究和染色体相关分析领域。SGI的设备很好地满足了这些使命对复杂计算和虚拟显示的需求。"
SGI公司CEO兼董事长BOB Bishop先生说："我们感到非常荣幸，致力于破坏性疾病研究的世界知名机构，上海药物研究所和中科院基因组生物信息学中心采用了我们的技术。SGI 将竭尽所能为这些研究机构所从事的重要工作提供服务。我们充分了解中国SARS病毒研究的急迫性，SARS便毒研究走向成功需要先进的技术支持。我们在高性能计算和虚拟显示领域的特长一定能加快病毒研究的步伐。"
SGI公司还宣布，日本Kitasato大学和SGI日本公司正在合作，进行SARS病毒蛋白质的三维结构研究，这将在世界范围内加速SARS疫苗的开发与研究。
